新疆石河子蔬菜研究所是1980年组建的蔬菜专业研究所，主要从事蔬菜和瓜类作物的育种研究以及蔬菜、瓜类、花卉的良种繁育、销售、栽培技术咨询等系列化服务。全所有专业技术人员39人，其中高级职称11人，中级职称16人。

以番茄、胡萝卜、辣椒等红色作物产品为原料的“红色产业”形成了新疆的特色产业，需要与产业发展相适应的优质、丰产、抗耐病品种应用于生产。近十后来，共培育了14个加工型蔬菜新品种。选育出了早熟、丰产和抗病加工番茄品种里格尔87-5为我区第一个加工番茄主栽品种，一般亩产5吨，最高可达10吨，在南北疆以及西北地区大面积推广，曾分别获得石河子和兵团科技进步一等奖。我所培育的杂一代加工番茄新品种石红二号（新番七号）、石红三号（新番八号）、石红四号、石红九号、石红十二号（新番十号）、石红十三号（新番十一号）、石红十四号、石红十五号、石红096（新番二十号）、石红201（新番二十一号）、石红206（新番二十二号）、和2007年通过登记的石红208等新品种，其高产、抗病和优质的加工特性受到用户的欢迎，平均增产15%，一般亩产7000～8000Kg。在南北疆乃至西北地区年推广面积达60万亩以上，可取得经济效益6亿元以上，新增效益1.4亿元。目前，由我所选育的加工番茄品种在生产上的覆盖率在国内可达80%。制干线椒品种石线一号、石线二号、新椒四号，为我区制干线椒的主栽品种，亩产干椒300Kg以上，年推广面积10余万亩。加工和鲜食兼用型胡萝卜新品种新胡萝卜一号（夏种秋收型）和春季专用品种石胡萝卜一号（春种夏收型），加工特性优良，一般亩产3500Kg，亩新增效益200元，并可进行搭配种植延长原料供应期，应用前景良好。新洋葱一号的育成为我区增添了第一个脱水加工和鲜食兼用的白皮型新品种。

为了丰富我区和兵团各族群众的菜篮子，促进我区和兵团的城郊蔬菜经济的发展和提高群众的生活水平，我所先后引进、筛选、培育、良繁和推广了150余个鲜食蔬菜品种，自主创新培育的鲜食蔬菜瓜类作物新品种有23个，其中包括新椒五号（牛角型）、新椒八号（甜椒型）、石椒一号（天椒五号）、石椒二号（薄皮筒型）、石椒三号（牛角型）、石椒四号（螺丝椒型）、新白一号（白帮叠抱型）、新白三号（青白帮叠抱型）、新茄一号（四倍体少籽型）、新茄二号（紫长茄）、新茄三号（紫圆茄）、石黄瓜一号、石黄瓜二号等。育成了若干适合温室大棚种植的精品西甜瓜品种，2007年通过审定的有天园礼品一号（新优38号）、天园礼品三号（新优39号）无籽西瓜和精品甜瓜品种天蜜一号（新优41号），2008年通过审定的有新优45号小西瓜新品种。我所培育的品种和提供的种子，质量可靠，种性稳定，一般增产10～15%，深受菜农的欢迎。许多蔬菜品种填补了我区的空白，多年来取得了明显的社会效益和经济效益。

“十五”期间我所完成的国家星火计划重点项目《加工番茄良繁与示范生产建设项目》在农场建设了2000亩加工番茄优良品种繁殖基地。在完成科技部《加工番茄滴灌技术研究与示范》项目的基础上，对植株需水规律进行了研究，对良繁基地的空气、土壤和水源进行了检测和评价。完成了加工番茄种果处理及种子初加工技术集成，配套建设了原种库和晒种场。年产加工番茄种子10吨以上，年产番茄酱1500吨以上。“十五”期间完成的国家星火计划重点项目《加工番茄生产技术培训体系建设》选派或选聘6名中级职称以上的专业技术人员作为基础力量，利用冬季给职工面授、发放资料，生长期深入到天山南北的番茄种植田间进行技术咨询，每年共培训数千人次。

近年，完成了国家科技部星火计划扶贫项目《170团温室大棚蔬菜基地建设》、《137团温室大棚蔬菜科技扶贫》项目、科企合作的《162团温室大棚蔬菜生产技术服务》和《163团温室大棚蔬菜生产技术服务》以及《鄯善县达朗坎温室大棚蔬菜生产技术服务》项目。多年来我所派谴科技人员和技术工人指导和推广蔬菜栽培管理新技术，并利用这些地区优良的光照资源优势，进行大棚春提早或秋延后生产，平均亩收益6000元以上。每亩温室蔬菜年新增收入2000元。按现有总面积3000亩温室大棚计，每年可新增收入600万元。促进了这些农场进行非宜棉区的农业结构调整，探索新的经济增长点，致富职工群众，促进边境蔬菜生产向邻国出口。